EMAIL : Frédéric Ducongé
Développer de nouvelles sondes de reconnaissance
moléculaire spécifique
Depuis plusieurs années, nous développons des méthodes innovantes de sélection d'aptamères qui ont conduit au dépôt de plusieurs brevets. Notre but est de pouvoir utiliser ces aptamères pour étudier les mécanismes impliqués dans les maladies neurodégénératives et développer de nouvelles approches thérapeutiques et diagnostiques.
Structure modélisée d'un aptamère
Les aptamères sont des ligands de haute affinité constitués de structures tridimensionnelles d'acides nucléiques (ARN, ADN ou chimie modifiées). Ils peuvent être sélectionnés par des méthodes d'évolution moléculaire in vitro contre de nombreuses cibles moléculaires (par exemple des protéines, des peptides ou des petites molécules chimiques comme des métabolites ou des neurotransmetteurs). Les aptamères présentent plusieurs avantages par rapport au anticorps. Par exemple, ils peuvent être produits chimiquement et sont très stables dans une large gamme de pH et de température. Ils peuvent ainsi être facilement conjugués à de nombreux composés pour créer de nouvelles sondes de reconnaissance moléculaire spécifique.
Suivi par microscopie de fluorescence de l'internalisation d'un aptamère anti-Annexin A2 dans des cellules. L'aptamère marqué en rouge se fixe rapidement à la surface des cellules puis est internalisé au cours du temps. (PLoS ONE 9(1): e87002.)
Notre activité de recherche concerne :
1- La sélection d'aptamères pouvant reconnaitre spécifiquement différents types d'agrégat de protéines impliquées dans les maladies neurodégénératives.
2- La sélection d'aptamères pouvant servir à l'imagerie in vivo de l'expression des gènes.
3- La sélection d'aptamères pouvant inhiber des protéines impliquées dans la mort neuronale.
Membres du laboratoire associés aux projets
- Alix Bouvier-Müller (Doctorante) - Contrat doctoral IRTELIS CEA. 2016-2019.
- Cynthia Forier (Ingénieur) - Contrat CDD CEA. 2017-2019
- Yann Bramoulle (Chercheur)
- Alexis Bemelmans (Chercheur)
- Nadja Van Camp (Chercheur)
- Thibault Percerou (Technicien)
- Gwenaëlle Aurégan (Technicienne)
- Emmanuel Brouillet (DR1-CNRS)
- Philippe Hantraye (DR1-CNRS)
Principales collaborations
- Ronald Melki, Paris-Saclay Institute of Neuroscience, Centre National de la Recherche Scientifique, Gif-sur-Yvette, France.
- LFB Biotechnologies, les Ulis, France
Publications récentes
Nucleic acid aptamers for neurodegenerative diseases
Bouvier-Müller, A. and Ducongé, F.
Biochimie 2017 j.biochi.2017.10.026.
DNA aptamer affinity ligands for highly selective purification of human plasma-related proteins from multiple sources
Forier, C., Boschetti, E., Ouhammouch, M., Cibiel, A., Duconge, F., Nogre, M., Tellier, M., Bataille, D., Bihoreau, N., Santambien, P. et al.
J Chromatogr 2017 A, 1489, 39-50.
Applications of High-Throughput Sequencing for In Vitro Selection and Characterization of Aptamers
Nguyen Quang, N., Perret, G. and Ducongé, F.
Pharmaceuticals 2016, 9, 76.
How to Measure the Affinity of Aptamers for Membrane Proteins Expressed on the Surface of Living Adherent Cells
Quang, N.N., Pestourie, C., Cibiel, A. and Duconge, F.
Methods 2016, 97, 35-43.
In Vitro and In Vivo Imaging of Fluorescent Aptamers
Theodorou, I., Quang, N.N., Gombert, K., Theze, B., Lelandais, B. and Duconge, F.
Methods Mol Bio 2016l, 1380, 135-150.1.