L'équipe SysFate dirigée par Marco Mendoza (Genoscope / Institut de Biologie François Jacob / site d'Évry), s'intéresse à la formation de tissus et aux différents programmes d'expressions géniques responsables de leur organisation spatiale.

Dans ce but, cette équipe développe des technologies capables de saisir l'expression des gènes sur des sections de tissus, notamment grâce à des puces à ADN qui capturent l'ARN messager puis l'analysent par séquençage à haut débit. Ainsi, elle arrive à digitaliser l'information acquise à partir du tissu.

Ses outils informatiques comme le MULTILAYER¹  traitent ensuite cette information : ce logiciel permet de révéler les sous-structures moléculaires des tissus, et d'explorer l'architecture des organes et des tissus sous l'angle des programmes génétiques impliqués dans leur complexité moléculaire.

Cet outil, en open access, permet la reconstitution d'images en 3D de la formation de tissus, pour une meilleure compréhension des mécanismes menant à leur formation.