Pour les échantillons d'ARN également, un contrôle qualité est systématiquement effectué. Chaque échantillon fait l'objet d'une quantification ainsi que d'une migration sur puce Bioanalyseur pour estimer la qualité de l'échantillon. Comme pour les ADNs, un rapport envoyé au collaborateur est systématiquement établi et les échantillons sont normalisés avant transfert aux équipes de production afin de permettre leur traitement dans un format haut débit.